Detalles de la búsqueda
1.
A draft human pangenome reference.
Nature
; 617(7960): 312-324, 2023 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37165242
2.
Active and repressed biosynthetic gene clusters have spatially distinct chromosome states.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(24): 13800-13809, 2020 06 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32493747
3.
Horizontal Gene Transfer Phylogenetics: A Random Walk Approach.
Mol Biol Evol
; 37(5): 1470-1479, 2020 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31845962
4.
Analysis of local genome rearrangement improves resolution of ancestral genomic maps in plants.
BMC Genomics
; 21(Suppl 2): 273, 2020 Apr 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32299356
5.
GraphTeams: a method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data.
BMC Genomics
; 19(Suppl 5): 308, 2018 May 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29745835
6.
Identifying gene clusters by discovering common intervals in indeterminate strings.
BMC Genomics
; 15 Suppl 6: S2, 2014.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25571793
7.
Training an automated circulating tumor cell classifier when the true classification is uncertain.
PNAS Nexus
; 3(2): pgae048, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38371418
8.
Constructing founder sets under allelic and non-allelic homologous recombination.
Algorithms Mol Biol
; 18(1): 15, 2023 Sep 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37775806
9.
Gene family assignment-free comparative genomics.
BMC Bioinformatics
; 13 Suppl 19: S3, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23281826
10.
Small parsimony for natural genomes in the DCJ-indel model.
J Bioinform Comput Biol
; 19(6): 2140009, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34806948
11.
The potential of family-free rearrangements towards gene orthology inference.
J Bioinform Comput Biol
; 19(6): 2140014, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34775922
12.
Computing the Rearrangement Distance of Natural Genomes.
J Comput Biol
; 28(4): 410-431, 2021 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33393848
13.
Correction: Constructing founder sets under allelic and non-allelic homologous recombination.
Algorithms Mol Biol
; 18(1): 20, 2023 Dec 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38057863
14.
Sequence-Based Synteny Analysis of Multiple Large Genomes.
Methods Mol Biol
; 1704: 317-329, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29277871
15.
Family-Free Genome Comparison.
Methods Mol Biol
; 1704: 331-342, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29277872
16.
Comparative scaffolding and gap filling of ancient bacterial genomes applied to two ancient Yersinia pestis genomes.
Microb Genom
; 3(9): e000123, 2017 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29114402
17.
The gene family-free median of three.
Algorithms Mol Biol
; 12: 14, 2017.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28559921
18.
New Genome Similarity Measures based on Conserved Gene Adjacencies.
J Comput Biol
; 24(6): 616-634, 2017 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28590847
19.
Orthology detection combining clustering and synteny for very large datasets.
PLoS One
; 9(8): e105015, 2014.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25137074
20.
Stochastic errors vs. modeling errors in distance based phylogenetic reconstructions.
Algorithms Mol Biol
; 7(1): 22, 2012 Aug 31.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22938153